shurakluev
А как эти белки понимают, что на ступил нужный момент, и что данная клетка это клетка мозга, а не печени? И т.п По ссылке этого нет..
Для это в клетках есть специальные ферменты, которые в зависимости от химического состава среды и электрического потенциала включат производство тех или иных белков. Читал про эксперименты, в которых электрически воздействием на разные участки тела эмбриона удавалось, например вырастить глаза на животе.
Гомеодоменные белки и эмбриональное развитие
Расшифровка механизма процесса дифференцировки и эмбрионального развития - одна из важнейших задач биологии. Оплодотворенное яйцо многоклеточного организма делится и дифференцируется в различные ткани: эпидермис, нервы, мышцы, печень и т. д. Поскольку каждая клетка имеет один и тот же набор генов, дифференцировка включает селективную экспрессию генов в различных тканях. О том, как это происходит, до сих пор известно немного. Однако несколько лет назад было идентифицировано несколько гомейотических генов, ответственных за правильное эмбриональное развитие. Их важность была установлена в ходе изучения влияния мутаций в этих генах на развитие плодовой мушки дрозофилы. Важным в рассматриваемом контексте моментом является то, что продукты гомейотических генов - все кодируемые ими белки - имеют сходные домены, именуемые гомеодоменами. Участки ДНК, кодирующие такие гомеодомены, называются гомеобоксами. Гомеодомены - это ДНК-узнающие белки длиной около 60 аминокислотных остатков; они напоминают фрагмент «спираль-поворот-спираль» с узнающей спиралью, расположенной в большой бороздке. Кодируемые гомейотическими генами белки связываются со специфическими участками ДНК. Поэтому можно предположить, что гомейотические гены кодируют факторы транскрипции. Хотя гены-мишени еще не известны, установлено, что в ряде случаев эти факторы служат активаторами одних генов и репрессорами других. Структура гомеодоменов характеризуется высокой степенью консервативности и высокой степенью сходства у насекомых (дрозофила) и позвоночных, включая человека.
У эукариот индукция определенных генов происходит под действием химических индукторов. В печени, например, фенобарбитал вызывает увеличение количества метаболизирующих его ферментов. Встречается и репрессия генов: холестерин, например, репрессирует первый фермент метаболического пути своего синтеза (см. с. 146). В большинстве своем подобные эффекты не столь критичны для жизнедеятельности клетки как, скажем, в случае lас-оперона, но все равно очень важны.
У животных имеется целый ряд гормонов и других регулирующих агентов, которые вызывают селективную модуляцию синтеза специфических белков, контролируя
транскрипцию их генов. Сложность таких регуляторных эффектов очень велика, и действительно, активность гена может контролироваться различными факторами (см. главу 26). Столь сложной регуляции у Е. coli не найдено.
У эукариот различные гены экспрессируются в разные моменты времени. Некоторые из них, так называемые гены домашнего хозяйства, экспрессируются постоянно и во всех тканях. Ферменты гликолиза, белки, необходимые для синтеза ДНК и белка, и т. д. нужны любым клеткам, так что гены «домашнего хозяйства» экспрессируются практически в каждой, кроме высоко специализированных клеток, например, зрелых эритроцитов. Другие белки необходимы только в специализированных тканях: незрелые красные кровяные клетки образуют гемоглобин; есть белки, специфичные для печени, мышц, почек и т. д. Каждый тип клеток одного организма содержат одинаковый набор генов. Это означает, что в мышечной клетке, например, экспрессируются только определенные гены. Однако проблема экспрессии тканеспецифичностью не исчерпывается: ведь в ходе эмбрионального развития на ранней стадии процесса дифференциации требуются одни гены, другие начинают работать позднее, в ходе развития отдельных тканей. Из этого следует, что гены эукариот, с одной стороны, могут экспрессироваться с постоянной скоростью конститутивно, с другой - подвержены множественному контролю различными гормонами и другими факторами.
Проблема заключается в том, что у прокариот можно «выключить» ген репрессором либо, в случае lас-оперона, - сАМР или лактозой. Но как осуществить множественную регуляцию гена эукариот?
Каким образом осуществляется избирательный контроль экспрессии генов? Это функция элементов, расположенных в разных участках ДНК. Даже на расстоянии тысяч пар оснований они могут влиять на транскрипцию гена. Например, присутствие в ДНК удаленного энхансера увеличивает в сотни раз транскрипцию гена β-глобина.
Ген β-глобина экспрессируется только в незрелых эритроцитах; его транскрипция зависит от связывания транскрипционного фактора с GАТА-боксом. Данный фактор присутствует лишь в этих клетках, что и обеспечивает специфичность экспрессии.
Сущность вариабельного контроля гена состоит в том, что ДНК-связывающие белки, например, факторы транскрипции и репрессоры, во многих случаях взаимодействуют с ДНК только после соответствующего «инструктажа». Мы уже познакомились с ситуациями, при которых активация транскрипционного фактора достигается аллостерической модификацией регуляторного белка при связывании лиганда (вспомним регуляцию lас-оперона). У эукариот такая «инструкция» обычно приходит в виде внешнего внеклеточного сигнала, скажем, гормона или фактора роста. Подобные механизмы активации факторов транскрипции рассмотрены в главе 26.
До сих пор мы знакомились с экспрессией гена, рассматривая ген только как матрицу ДНК. Однако есть много других важных и интересных вопросов, например, каким образом, в клетке происходит отбор генов, подлежащих экспресии? Как РНК-полимераза «узнает»,
с какого места в транскрибируемом гене нужно начинать копирование ДНК и где остановиться? Каким образом контролируется скорость экспрессии гена? Один белок, кодируемый своим геном, может образовываться в больших количествах, а другой - в очень малых или не образовываться совсем. Некоторые гены могут быть экспрессированы только в определенное время. Как же это достигается? Для ответа на поставленные вопросы мы должны рассмотреть структуры реальных генов, точнее, последовательности их оснований.
Контроль транскрипции различными сигма-факторами
Сигма-факторы являются одним из эффективных «инструментов» контроля целых блоков генов у прокариот. При определенных условиях обычный сигма-фактор заменяется иным, который побуждает полимеразу инициировать транскрипцию другого набора генов. К таким условиям относятся: 1) споруляция бацилл, когда после получения сигнала о неблагоприятных условиях окружающей среды образуется новый сигма-фактор; это вызывает экспрессию ряда генов, ведущих к споруляции; 2) азотное голодание, при котором образуется особый фактор; 3) тепловой шок (внезапный подъем температуры), после которого у Е. coli временно увеличивается синтез, стабильность и активность другого сигма-фактора, чей уровень в норме очень низок. Этот фактор управляет транскрипцией генов, кодирующих «белки теплового шока», которые защищают клетку от его последствий.
На образование ферментов затрачиваются ресурсы и энергия, и, если в данный момент эти ферменты не нужны, Е. coli не будет их синтезировать. Как уже отмечалось, конститутивные ферменты образуются постоянно при любых обстоятельствах. Поскольку глюкоза является основным сахаром, а другие сахара могут пойти по пути метаболизма глюкозы, ферменты, метаболизирующие глюкозу, - конститутивны. Клетка «предполагает», что они будут нужны всегда, поэтому промоторы кодирующих их генов не имеют «выключателя», они постоянно «включены».