На это есть несколько причин - физических, биологических и производственных.
Вирусы и бактерии, обычно гибнут за короткое время под прямыми солнечными лучами и при повышении температуры окружающей среды. Поскольку солнечных лучей становится меньше, а температура ниже, концентрация этих организмов увеличивается.
Общее здоровье человека сильно зависит от потребления кислорода. В пасмурную погоду, во время прохождения циклонов, падает атмосферное давление и парциальное давление кислорода. При слабых лёгких потребление кислорода уменьшается. Обменные процессы идут медленнее. Падает температура тела. Уменьшается активность лейкоцитов.
На сон человека влияет влияет выработка гормона мелатонина. Он начинает выделяться вечером по мере уменьшения освещённости. При этом наблюдается замедление пульса, вялость и снижение температуры. Поскольку вечереет всё раньше и раньше, вялость, апатия и депрессия возрастают.
Влажный воздух имеет более высокую теплоёмкость. Во влажную ветреную погоду охлаждение организма происходит гораздо быстрее, чем в сухую безветренную. Механизм терморегуляции не может перестроиться под это быстро. В охлаждённых суставах возможны микротравмы.
Производственная причина. У нас со времён СССР никак не могут забыть слово план. Все планы как правило нужно выполнить до конца года. Представители бюджетных учреждений как правило не хотят даже слышать, что возможна какая-то задержка, а то на следующий год выделят меньше. В результате в середине октября начинается гонка до конца года, т.е. сверхурочные работы в том числе в выходные, в проливной дождь. Все ходят, держаться за голову, кашляют, чихают, надрываются на стройке и т.д.